内部大厅高逾十丈，顶部为六重穹顶构造，每一层皆嵌有描绘过去神话时代的浮雕与星象图，能随着时间与灵力变化而流转图像。
厅堂地板以冰晶石铺陈，行走其上彷若踩踏湖面，镜面彷佛能反射出每个人的真相之影。
主阁楼右侧是神明们的居所，称为「静心阁」，采用环绕式回字结构设计，中央为供日常活动与小型祭祀所用的内庭，种植着象徵着神力的神树花，每逢晨曦初照时，花瓣会根据光影闪现不同色彩，为整座楼增添神秘气息。
每位神明的居所皆於楼翼的不同方向，内部装潢依照各神明偏好布置。
天照大神所居的阳明厅以金光云纹为主，通体明亮温暖；而月读的月影室则以水墨绘墙，气氛幽寂清冷。
房间中除有日常起居外，也有隐密的侍从通道与传送阵，便於部下隐秘移动与紧急通报。
静心阁右侧的阁楼为「灵御阁」，这里为辅助神明选中之人进行精神昇华与深化的场所，整栋建筑以八角设计构成，象徵「天地八方皆通神途」。
主殿为「神契堂」，堂内有一道高耸如碑的晶墙，名为「神御壁」，能投影过去神明的残响或记忆，能在选中之人修炼或接受启示时引导他们。
两侧设有「御心池」与「明息亭」，前者是一片静止之水镜池，可反映出修行者内心最深的疑问与恐惧；後者为供冥想的静谧空间，空间中被施加净化魔法，有助於修炼感知与精神专注。
灵御阁对外不开放，仅限神选之人可以入内，据说每位真正完成灵御试炼的人，力量皆能得到进一步的昇华。
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